La conception technique et institutionnelle du CEREEAC est le résultat d'un processus consultatif complet mené par la Communauté économique des États de l'Afrique centrale (CEEAC) en partenariat avec l'Organisation des Nations unies pour le développement industriel (ONUDI) entre 2020 et 2021. Ce processus a permis d'évaluer la valeur ajoutée et la faisabilité du centre, tout en définissant son cadre technique et institutionnel.

Il comprenait l'élaboration d'une étude de référence et d'une évaluation des besoins, et s'inscrivait dans le droit fil des efforts déployés par l'Agence internationale pour les énergies renouvelables (IRENA) afin de concevoir une feuille de route pour les énergies renouvelables dans la région de l'Afrique centrale.

La création du CEREEAC a été approuvée par les ministres de l'Énergie le 8 juin 2021 et officiellement entérinée par la décision n° 04/CEEAC/CCEG/XIX/21, adoptée lors de la 19e Conférence des chefs d'État et de gouvernement à Brazzaville le 30 juillet 2021.

Le CEREEAC a obtenu une identité juridique à part entière à la suite de la signature de l'accord de pays hôte entre la CEEAC et le gouvernement angolais le 3 novembre 2021, confirmant l'Angola comme pays hôte de son siège. Le centre a été officiellement inauguré à Luanda le 10 mars 2023.

Sa première phase opérationnelle est soutenue par l'ONUDI avec un financement de la Coopération autrichienne au développement. Le CEREEAC collabore également étroitement avec d'autres membres du Réseau mondial des centres régionaux pour l'énergie durable (GN-SEC).